一場“完美風(fēng)暴”即將襲擊Atlantis，Atlantis的人員必須緊急撤離。Sheppard請求Manara的首領(lǐng)Smeadon允許Atlantis暫時(shí)撤離到他們的星球，Smeadon暗地里卻通知了Genii的首領(lǐng)Cowen（他們剛剛和Atlantis結(jié)下梁子）。Cowen派遣指揮官Kolya集結(jié)了一個(gè)突擊小隊(duì)準(zhǔn)備襲擊Atlantis。

McKay和Zelenka計(jì)劃使用避雷針從雷電中吸取瞬間能量（弗蘭克林的夢想），啟動城市的防御護(hù)盾，從而保護(hù)城市免受風(fēng)暴的破壞，但這樣一來，只能留下幾個(gè)人，其他人必須全部離開（整個(gè)城市都導(dǎo)電了）。與此同時(shí)，Teyla、Ford和Carson在陸地組織Athos人撤離，最后一批獵人回來的太晚，Jumper無法安全返回，一行人暫時(shí)被困在了那里。

Kolya在Smeadon的幫助下，抓住了一個(gè)Athos人（喝酒誤事?。?，脅迫他撥通星門并發(fā)送IDC（身份驗(yàn)證），Genii突擊隊(duì)冒充受傷的Athos人闖入了Atlantis，殺死了兩名守衛(wèi)，并抓住了Weir和McKay。此時(shí)Sheppard正在切斷城區(qū)的四個(gè)避雷針，通過無線廣播得知了Weir和McKay的遭遇，他搶先一步藏起了Kolya想要的C4。氣急敗壞的Kolya現(xiàn)在計(jì)劃要?dú)⑺繵eir并占領(lǐng)整個(gè)Atlantis。