1898年12月，西班牙與美國簽訂巴黎條約，標(biāo)志著兩國戰(zhàn)爭正式結(jié)束，西班牙戰(zhàn)敗其殖民地菲律賓也易主，因此在巴萊爾的被困者便被稱為《最后的菲律賓人》。1899年，胡里安他們還被困在巴萊爾的小教堂內(nèi)，而阿隆索則以信使的身份進入那間教堂救胡里安。三十七天前，艾琳通過胡里安給士兵們寫的家書，確定了胡里安的下落，于是派阿隆索前來救胡里安，并帶來讓最后的菲律賓人投降的信件。最后的菲律賓人即將面臨的是長達337天的拘押，阿隆索帶來了名單，為保證一切恢復(fù)歷史原樣，讓胡里安跟他一起離開，可胡里安卻在得知了西班牙戰(zhàn)敗之后，想留下來救更多的人。中尉因為阿隆索和胡里安的認(rèn)識，懷疑他是間諜，而中尉也不相信西班牙軍隊已經(jīng)離島，所以正跟屬下商量著如何對付阿隆索。還沒有想辦法對付阿隆索，美軍就闖進了教堂，阿隆索在關(guān)鍵的時候，救了中尉一命，才讓中尉信任于他。艾米利亞因為阿隆索長時間沒有歸隊，懷疑薩爾瓦多所說將阿隆索送去培訓(xùn)的事情，忍不住向艾琳質(zhì)問。再次收到西班牙的信件，宣布西班牙戰(zhàn)敗的消息，可中尉還是不肯相信這是事實，怎么也不肯投降，仍然讓大家堅守在教堂內(nèi)。上尉因為腳氣病，病死在了教堂內(nèi)，最后的菲律賓人便簡單地為他舉行葬禮。胡里安想改變一切，卻什么也改變不了，名單上的死亡人員名單，正一個個離他而去。阿隆索和胡里安商量，要從側(cè)墻逃跑，因為上次被轟炸之后，他在那面墻做了手腳，只要將磚搬開就可以離開，可沒想到他們在離開的時候，卻被中尉給發(fā)現(xiàn)了。逃跑不成，胡里安他們都被當(dāng)成了逃兵，連跟他們一起逃跑的托卡等人也被捆綁了起來。胡里安想為托卡他們求情，很生氣地頂撞了中尉，結(jié)果被中尉打了一巴掌，讓阿隆索差點又為此與中尉起沖突。醫(yī)生通知胡里安他們，晚上會有混亂，讓他們趁那個時間逃跑，而就在逃跑的時候，胡里安和阿隆索解開了他們身上的手銬，只有托卡等人被銬在倉庫里。胡里安很想把托卡他們救走，阿隆索只能提醒胡里安，他們在名單之上，讓胡里安放下他們離開，胡里安最終也只能不顧托卡他們的性命先逃跑了。艾米利亞因為知道了自己的終結(jié)，一直惴惴不安，在帕西諾一次次的安慰之中，她最終決定接受帕西諾，而此時阿隆索也成功將胡里安帶回了時間管理局。艾米利亞聽到了胡里安回來的消息，非常的驚喜，可那份驚喜沒有停留太長時間，她就陷入了另一番復(fù)雜的情緒當(dāng)中。胡里安回來后，便想知道最后的菲律賓人的結(jié)局，于是翻開書本查看他們各自的結(jié)局。中尉拿到了報紙，得知了西班牙戰(zhàn)敗的消息，但他仍不打算投降，而是槍斃了托卡他們，準(zhǔn)備趁夜突圍。