李斯(張子健 飾)把整理好的文學館的東西交給了趙高(畢彥君 飾)讓他呈給圣上看，趙高問他是不是奏明文學館的事情，李斯聽了之后想了想說他不知道趙高到底想知道什么?；噬峡戳俗嗾壑髿獾貌恍?，他說這幫儒生真是妄論朝政可惡至極，扶蘇(程皓楓 飾)長公子怎么能和這幫人混在一起。蒙毅(李源 飾)看了之后說還是把李斯丞相叫過來問清楚才好。

皇上讓李斯把文學館的由來好好跟他說說清楚，蒙毅知道事情不妙之后趕緊去問扶蘇說他是不是有趣文學館了，那地方有什么好的。扶蘇聽了之后說他自己也說不清楚，李斯說皇上不必太惱火，只要教訓一下扶蘇就行了。第二天皇上親自宴請朝廷眾位大臣和學士們，不議政事只管喝酒。

皇上出來之后質問那些儒士們說自己養(yǎng)他們是為了讓他們?yōu)榇笄氐慕匠鲋\劃策，他告訴淳于越(關景利 飾)說和眾人說自己與他們喝完了一杯酒就要宣布一個特殊的詔令，扶蘇先行告退了。隨后皇上讓李斯宣讀了詔書，焚毀了百家書籍，有人敢談古論今者滅九族，這就是有名的焚書坑儒事件。

扶蘇知道了大事不好之后讓淳于越的女兒喬女(蔣靖 飾)跟著自己走，他把喬女打扮成了一個軍士帶回了自己的府上面。這時候李賢(張璇 飾)剛好看到了扶蘇帶著喬女，她問扶蘇這女子是誰，扶蘇沒有解釋清楚，李賢生氣的走了。李賢在外面遇到了蒙毅，李賢求蒙毅去勸勸扶蘇，蒙毅問明白了事情的原因之后去找了扶蘇。

蒙毅去問扶蘇是不是真的要金屋藏嬌，扶蘇聽了之后說自己不是金屋藏嬌，那女的是淳于越之女，蒙毅聽了之后說他為什么要冒天下之大不為，要是皇上知道了肯定會生氣的。扶蘇找了一個安全的地方把喬女安頓了下來，扶蘇準備去找皇上說讓他停止焚書坑儒的詔令，蒙毅和靈兒沒有攔住他。

皇上聽了扶蘇的話之后十分的生氣，他給扶蘇說了一番關于治理江山的道理，還說只要是誰敢挑釁自己的天下，自己一樣不會心慈手軟。扶蘇說既然是這樣就讓他也把自己給治罪殺了，秦始皇(寇世勛 飾)聽了之后生氣的不行，他心力憔悴的吐了口血?；噬狭P扶蘇去秦直道那里面當監(jiān)軍，喬女說自己不能再連累扶蘇了，扶蘇說自己會帶她一起走的。

李斯告訴自己的女兒李賢說不管扶蘇走到哪里都讓她跟著扶蘇，這樣他才能打動扶蘇的心?；噬细嬖V扶蘇說自己讓他去邊關就是為了歷練他，這樣才能成熟起來，扶蘇回家之后看到李賢在整理東西，他說不讓李賢跟著自己一起去邊關，因為那里十分的疾苦。