十多年之后，李時(shí)珍和義弟李行義(萬思維 飾)，還有李言聞收養(yǎng)的好友之女斯語都長大成人。李行義跟著李言聞學(xué)習(xí)醫(yī)術(shù)，李時(shí)珍則按照父親的要求一心科舉，只能暗地里偷學(xué)醫(yī)術(shù)。李時(shí)珍入書院的第一天因搶了荊王世子朱成翊(王雨 飾)的風(fēng)頭，從此便成了朱成翊的眼中釘。在書院時(shí)間越長他與朱成翊的積怨越深。在王府的干預(yù)下，李時(shí)珍不得不退出書院，回家自學(xué)。不久，朱成翊的愛妃因喝了李言聞開的藥后暴亡。朱成翊要斬李言聞，幸虧荊王府郡主朱萇葶(崔波 飾)出面求情。朱成翊答應(yīng)給李家三天時(shí)間找出原因，否則定斬不饒。李時(shí)珍和李行義通過朱萇葶找到世子妃用過的藥渣，發(fā)現(xiàn)里面少了一味叫黃精的藥，而多了一味不知名的藥，這讓兄弟倆大為疑惑。