芬奇和里瑟成功保護(hù)了“機(jī)器”核心并在根的幫助下重建了“機(jī)器”，與此同時(shí)“撒馬利亞人”組織對(duì)他們一伙人的追殺仍在持續(xù)著。在“機(jī)器”的掩護(hù)下，他們繼續(xù)隱藏身份維持正義，制止犯罪。肖被“撒馬利亞人”控制著并試圖通過(guò)她找到“機(jī)器”的下落，但肖通過(guò)頑強(qiáng)的意志成功逃了出來(lái)并與根他們會(huì)合。芬奇不小心暴露了行蹤，“撒馬利亞人”的殺手對(duì)他們展開(kāi)了窮追不舍的追殺，最終芬奇的好友根和以利亞在保護(hù)芬奇的途中犧牲。悲痛的芬奇決定放棄自己那一直謹(jǐn)守的規(guī)則與“撒馬利亞人”正式開(kāi)戰(zhàn)，他盜取了電腦病毒冰封9來(lái)對(duì)抗“撒馬利亞人”，最終在里瑟和肖的幫助下他成功開(kāi)啟了病毒，為了解決掉“撒馬利亞人”的最后備份，芬奇和里瑟做出了最后的努力，最終“撒馬利亞人”被徹底摧毀，而“機(jī)器”用自己留存下來(lái)的備份重獲新生并繼續(xù)著自己的使命。