藤丸順利制止了Hornet組織的壯烈戰(zhàn)斗計劃，也成功控制了利用網(wǎng)絡犯罪的魔彈之射手，但令人意想不到的是，藤丸又遭遇了新敵人的攻擊，而且這個人竟然還是和他一起打工的同事響。對于沒有預料到的朋友的背叛，藤丸無法掩飾內(nèi)心的動搖，就在藤丸遇到危機這時，本來早已失蹤的音彌突然出現(xiàn)了，事情朝著更加讓人想象不到的方向發(fā)展。為了追查逃走的響究竟在何方，藤丸開始了黑客行動，陪在他身邊的音彌接到了瑪雅的一封手機郵件，對方請求幫忙調(diào)查一個叫永田三郎的人物，他曾要求釋放魔彈之射手。音彌馬上拜托藤丸幫忙調(diào)查永田三郎的下落，可是藤丸卻覺得音彌有些不對勁，心里開始有疑問。另一方面，瑪雅接受九條的命令，正在秘密調(diào)查永田和“第三個皇帝”之間的關系，她和藤丸、音彌合作調(diào)查，終于查到了“第三個皇帝”的住處，但是他們?nèi)齻€人并不知道在那里等待他們的究竟是什么。